Фантастический мини-сериал «Секретное вторжение» основан на одноименной серии комиксов Marvel Comics и рассказывает об опасных приключениях бывшего директора организации Щ.И.Т. Ника Фьюри, которому предстоит ответственная миссия по спасению планеты. После ухода Ника в организации стало все очень плохо. Среди расы инопланетян скруллов назрел заговор с целью захвата и контроля различных сфер жизнедеятельности людей. Они успешно маскируются и начинают секретное вторжение на Земле. Но Ник Фьюри много лет проработал со скруллами и прекрасно знает, как нужно действовать. В этой битве он будет сражаться один.